Organizace zanikne jestliže příslušná oblastní, okresní, městská organizace nebo příslušná ústřední odborná komise vezme na vědomí zápis z členské schůze organizace a likvidační protokol o provedené likvidaci a předloží Svazu v Praze 8, Maškova 3 návrh na výmaz z registru organizací.
Zánik organizace oznamuje likvidátor Českému statistickému úřadu, případně místně příslušnému finančnímu úřadu.
Sloučení organizací lze uskutečnit, pokud s tím vysloví souhlas členské schůze slučovaných organizací. Součástí tohoto rozhodnutí musí být určení, která z organizací zanikne a která organizace se stane sloučenou organizací. Sloučení se uskuteční převodem členů ze zanikající organizace a převodem veškerého majetku a závazků do organizace sloučené. Podkladem jsou revizní zprávy revizních komisí slučovaných organizací ne starší 3 měsíců. O sloučení se zpracovává zápis. Sloučení organizací bere na vědomí příslušná oblastní, okresní, městská organizace nebo příslušná ústřední odborná komise. V případě, že dochází ke sloučení organizací sousedících oblastí je třeba ke sloučení souhlas příslušných oblastních, okresních, městských organizací. Zánik organizace se oznamuje do registru organizací Svazu v Praze 8, Maškova 3. S Českým statistickým úřadem je třeba projednat platnost a zrušení identifikačních čísel. Oznámení se podává případně i místně příslušnému finančnímu úřadu.
K rozdělení organizace se přistupuje zpravidla z důvodu vysokého počtu členů v organizaci. Rozdělení organizace projednává a schvaluje členská schůze organizace. Rozhodnutí musí obsahovat určení, zda stávající organizace rozdělením zanikne a vzniknou nové organizace nebo bude současná organizace dál vyvíjet činnost a vyčleněním vznikne další organizace ČSCH. Součástí rozhodnutí o rozdělení organizace je rozhodnutí o rozdělení majetku. Podkladem pro rozdělení majetku je aktuální revizní zpráva. Při dělení majetku se přihlíží např. k rozsahu a charakteru majetku, k počtu členů, k potřebám organizací atp. .
Rozdělením organizace není, jestliže část členů organizace z organizace vystoupí a založí novou organizaci, aniž by tomuto počínání předcházelo rozhodnutí členské schůze o rozdělení organizace. V takovém případě se jedná pouze o přestup členů z jedné organizace do jiné bez nároku na majetkové vypořádání. Podíl na majetku určitého účelu lze přiznat v případech přestupu části členů ze všeobecné organizace do organizace specializované nebo jinak pouze dohodou.